Se localiza entre los paralelos 21° 02’ y 21° 06’ latitud norte y los meridianos 89° 22’ y 89° 25’ latitud oeste. Limita al norte con Baca – Mocochá, al sur con Tixkokob – Tixpéhual, al este con Muxupip, y al oeste con Conkal.
Extensión.
El municipio de Yaxkukul ocupa una superficie de 43.43 Km2.
Principales Localidades.
La cabecera del municipio es el Pueblo de Yaxkukul. Además de la cabecera, dentro de la jurisdicción municipal quedan comprendidas cinco localidades: San Juan de las Flores, Hacienda Chac-Abal, San Francisco, Santa Cruz Canto y Yaxcopoil.
Orografía.
Toda la superficie del territorio es plana. Se clasifica como llanura de barrera, con piso rocoso o cementado, alta, escarpada y compleja.
Hidrografía.
En el territorio municipal no existen corrientes superficiales de Agua. Sin embargo en el subsuelo se forman depósitos comunmente conocidos como cenotes. En algunos casos los techos de estos se desploman y forman las Aguadas.
Clima.
Cálido sub-húmedo, con lluvias en verano. Cuando éstas se interrumpen se presenta la sequía de medio verano. La temperatura media anual es de 26.5ºC. y una precipitación pluvial media de 29.5 milímetros. Predominan los vientos con dirección sureste.
Flora.
La flora está clasificada como selva baja caducifolia con vegetación secundaria. Se hallan las especies amapola, alché, bojom y chacá entre otras.
Fauna.
Las especies de fauna existente son las siguientes: mamíferos: tlacuache, mono araña, conejo, mapache y venado. Reptiles: iguanas, serpientes y tortugas. Aves: chachalaca, chivicoyo, pavo de monte.
Características y Uso de Suelo.
El origen geológico del municipio corresponde a la era terciaria. La composición del suelo corresponde al tipo regosol que se encuentra en toda la región.
FUENTE: https://www.yucatan.gob.mx/estado/ver_municipio.php?id=105